O nás

Podrobnější informace jsou k dispozici na stránkách Intrawebu v sekci MS core facility.

Pokroky ve vědě o lipidech prohloubily naše porozumění funkce lipidů v biologických systémech. Hmotnostní spektrometrie (MS) hraje klíčovou roli v analýze lipidů a nabízí vysokou citlivost pro jejich identifikaci a kvantifikaci. Tandemová MS s kolizně indukovanou disociací (CID) je široce využívána pro strukturní analýzu, často však nedokáže rozlišit klíčové strukturní znaky, zejména u izomerních lipidů. K překonání těchto omezení se stále častěji používají alternativní metody, jako je UV fotodisociace (UVPD). UVPD zpřístupňuje odlišné fragmentační dráhy a otevírá nové možnosti strukturní analýzy, přestože její základní mechanismy zůstávají pouze částečně pochopeny. V naší nedávné studii jsme pozorovali fotofragmentaci lithiem kationizovaných voskových esterů a navrhli mechanismus zahrnující fotochemii typu Norrish–Yang. Tento projekt se bude detailně zabývat fotofragmentací za využití kombinace experimentálních a teoretických přístupů. Zaměříme se na třídy lipidů, u nichž je CID nedostatečná, s cílem ukázat, že fragmentace řízená UVPD umožňuje získat strukturní informace nad rámec možností CID.

 

Projekt je zaměřen na využití molekulových sít pro prekoncentraci lipidů s větvenými alifatickými řetězci. Tyto lipidy zastávají důležité biologické funkce a uplatňují se při mnoha závažných chorobách. Analýzu těchto lipidů komplikují jejich nízké koncentrace v biologických vzorcích. Vedle majoritně zastoupených lipidů s lineárními alifatickými řetězci tak snadno uniknou detekci. V projektu navrhujeme využít molekulová síta k odstranění majoritních lipidů s lineárními alifatickými řetězci z lipidových extraktů. Ve vzorcích tak zůstanou jen lipidy s větvenými řetězci, které je pak možné analyzovat pomocí HPLC-MS2 nebo GC-MS. Jedná se o zcela nový přístup k analýze větvených lipidů, který – pokud se prokáže jako účinný – může zásadním způsobem posunout možnosti lipidomické analýzy. Molekulová síta se používají pro průmyslové separace uhlovodíků v petrochemickém průmyslu, a jak naznačují i naše předběžná data, dají se použít v mikroměřítku pro analytické separace uhlovodíků. Selektivní separace lipidů s funkční skupinou, jako jsou například methylestery mastných kyselin (FAME), pomocí molekulových sít zatím v literatuře dokumentováno není. V rámci tohoto projektu budeme nejprve vyvíjet spolehlivou metodu separace uhlovodíků aplikovatelnou např. na dělení kutikulárních uhlovodíků sociálního hmyzu, a poté se zaměříme na dělení lineárních a větvených FAME. Metodu ověříme na komplexním vzorku FAME získaném transesterifikací celkového lipidového extraktu novorozeneckého mázku.